يتكون مؤشر تغطية المنطقة المحمية حاليا من مجموعة مركبة من ثلاثة مؤشرات فرعية تساعد معا على قياس التقدم المحرز نحو تحقيق أهداف اتفاقية التنوع البيولوجي : 1) درجة حماية المناطق الأيكولوجية الأرضية والبحرية في العالم، (2) درجة حماية المناطق الهامة للطيور ، و (3) درجة حماية مواقع التحالف من أجل صفر الانقراض. تمثل كل من المناطق الهامة للطيور والتحالف من أجل صفر الانقراض نوعين من المناطق الرئيسية للتنوع البيولوجي، أي وضع الأولويات حسب حجم الموقع للحفاظ على التنوع البيولوجي، والتي تتوفر حولها بيانات عالمية.
تحسب المؤشرات الفرعية على أساس تغطيات المناطق الأيكولوجية، والمناطق الهامة للطيور والتحالف من أجل صفر الانقراض مع جميع المناطق المحمية المعينة على الصعيد الوطني والمسجلة في قاعدة البيانات العالمية الخاصة بالمناطق المحمية المعروف مساحتها. تمثل قاعدة البيانات العالمية بشأن المناطق المحمية أكثر البيانات المكانية العالمية شمولية فيما يتعلق بالمناطق البرية والبحرية المحمية المتاحة. تعد المنهجية المستخدمة لإنشاء المناطق المحمية العالمية طبقة من قاعدة البيانات العالمية بشأن المناطق المحمية وتتبع المنهجية التي تستخدم لحساب مؤشر تغطية المناطق المحمية.
يمكن أن يتم استخدام المؤشر في تقييم حالة الحماية أو اتجاهات الحماية على مدار الوقت. ويمكن تطبيقها على نطاقات واسعة لقياس مدى استجابة السياسة لفقدان التنوع البيولوجي. يعمل UNEP-WCMC بشكل وثيق مع Alliance for Zero Extinction، BirdLife International ، و Conservation Internationaمن أجل تحسين قواعد البيانات والمنهجية المستخدمة لحساب مؤشرات حماية المناطق الهامة للطيور و التحالف من أجل صفر الانقراض. كما تعمل UNEP-WCMC مع الصندوق الدولي للحياة البرية لتحليل درجة حماية أنهار العالم.